عملکرد صندوق توسعه ملی از آنجا که این نهاد تحت تأثیر عواملی از جمله بودجه محدود، نارسایی منابع مالی، واگذاری پروژهها به سایر نهادها، تغییر در سیاستهای دولت و تورم قرار گرفته است. این عوامل باعث کاهش توانایی و عملکرد صندوق توسعه ملی در تحقق اهداف توسعه اقتصادی و اجتماعی کشور شده است.