کیست تخمدان میتواند باعث عدم تولید تخمک، نارسایی تخمدان و نقص هورمونی شود که همگی موجب ناباروری در زنان میشوند. این مشکل ممکن است باعث عدم تناسلی، سقط جنین یا مشکلات دیگر در بارداری گردد. درمان زمانی اهمیت دارد که مشکلات جدی ایجاد شود و با قطعی کیستهای بزرگتر مانع رشد کیست ها و ایجاد مشکلات جدی شود.