درمان عفونت زگیل تناسلی از جمله امر پیچیدهای است که نیاز به مراجعه به پزشک دارد. بهترین روش درمان این بیماری ممکن است شامل داروهای ضد باکتریایی مانند آزیترومایسین و سیپروفلوکساسین، داروهای ضد التهاب و مسکن درد، همراه با طرح درمانی برای همسران شامل داروها و از روشهای پیشگیری مانند استفاده از کاندوم در جلوگیری از انتقال عفونت به همسران. اهمیت مراجعه به پزشک و انجام تستهای دقیق برای تشخیص صحیح و درمان موثر این بیماری بسیار حائز اهمیت است.