درمان تیروئید کاسته شامل مصرف داروهای هورمون تیروئید برای جبران کمبود هورمون تیروئید است. برای درمان تیروئید اضافه نیز از داروهای ضدتیروئید مانند متیمازول استفاده میشود. علاوه بر این، در صورت نیاز ممکن است جراحی برای برداشتن بخشی از تیروئید انجام شود. همچنین در بعضی موارد، درمان با رادیواکتیو ایودین استفاده میشود که باعث قطعی فعالیت اضافه تیروئید میشود.